| The bacteriology of pouchitis: a molecular phylogenetic analysis using 16S rRNA gene cloning and sequencing. | |
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MedLine Citation:
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PMID: 20562611 Owner: NLM Status: MEDLINE |
Abstract/OtherAbstract:
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OBJECTIVE: To identify, compare, and contrast the microbiota in patients with and without pouchitis after restorative proctocolectomy (RPC) for ulcerative colitis (UC) and familial adenomatous polyposis (FAP). SUMMARY BACKGROUND DATA: Pouchitis is the most common complication following RPC. An abnormal host-microbial interaction has been implicated. We investigated the pouch microbiota in patients with and without pouchitis undergoing restorative proctocolectomy for UC and FAP. METHODS: Mucosal pouch biopsies, taken from 16 UC (pouchitis 8) and 8 FAP (pouchitis 3) patients were analyzed to the species (or phylotype) level by cloning and sequencing of 3184 full-length bacterial 16S rRNA genes. RESULTS: There was a significant increase in Proteobacteria (P = 0.019) and a significant decrease in Bacteroidetes (P = 0.001) and Faecalibacterium prausnitzii (P = 0.029) in the total UC compared with the total FAP cohort, but only limited differences were found between the UC nonpouchitis and pouchitis groups and the FAP pouchitis and nonpouchitis groups. Bacterial diversity in the FAP nonpouchitis group was significantly greater than in UC nonpouchitis (P = 0.019) and significantly greater in UC nonpouchitis compared with UC pouchitis (P = 0.009). No individual species or phylotype specifically associated with either UC or FAP pouchitis was found. CONCLUSIONS: UC pouch patients have a different, less diverse, gut microbiota than FAP patients. A further reduction in bacterial diversity but no significant dysbiosis occurs in those with pouchitis. The study suggests that a dysbiosis occurs in the ileal pouch of UC RPC patients which predisposes to, but may not directly cause, pouchitis. |
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Authors:
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Simon D McLaughlin; Alan W Walker; Carol Churcher; Susan K Clark; Paris P Tekkis; Matthew W Johnson; Julian Parkhill; Paul J Ciclitira; Gordon Dougan; Ralph John Nicholls; Liljana Petrovska |
Publication Detail:
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Type: Comparative Study; Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't |
Journal Detail:
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Title: Annals of surgery Volume: 252 ISSN: 1528-1140 ISO Abbreviation: Ann. Surg. Publication Date: 2010 Jul |
Date Detail:
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Created Date: 2010-06-23 Completed Date: 2010-07-12 Revised Date: 2012-03-08 |
Medline Journal Info:
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Nlm Unique ID: 0372354 Medline TA: Ann Surg Country: United States |
Other Details:
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Languages: eng Pagination: 90-8 Citation Subset: AIM; IM |
Affiliation:
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Department of Biosurgery and Surgical Technology, St Mary's Hospital, Imperial College London, London, United Kingdom. |
| Data Bank Information | |
Bank Name/Acc. No.:
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GENBANK/GQ156578; GQ156579; GQ156580; GQ156581; GQ156582; GQ156583; GQ156584; GQ156585; GQ156586; GQ156587; GQ156588; GQ156589; GQ156590; GQ156591; GQ156592; GQ156593; GQ156594; GQ156595; GQ156596; GQ156597; GQ156598; GQ156599; GQ156600; GQ156601; GQ156602; GQ156603; GQ156604; GQ156605; GQ156606; GQ156607; GQ156608; GQ156609; GQ156610; GQ156611; GQ156612; GQ156613; GQ156614; GQ156615; GQ156616; GQ156617; GQ156618; GQ156619; GQ156620; GQ156621; GQ156622; GQ156623; GQ156624; GQ156625; GQ156626; GQ156627; GQ156628; GQ156629; GQ156630; GQ156631; GQ156632; GQ156633; GQ156634; GQ156635; GQ156636; GQ156637; GQ156638; GQ156639; GQ156640; GQ156641; GQ156642; GQ156643; GQ156644; GQ156645; GQ156646; GQ156647; GQ156648; GQ156649; GQ156650; GQ156651; GQ156652; GQ156653; GQ156654; GQ156655; GQ156656; GQ156657; GQ156658; GQ156659; GQ156660; GQ156661; GQ156662; GQ156663; GQ156664; GQ156665; GQ156666; GQ156667; GQ156668; GQ156669; GQ156670; GQ156671; GQ156672; GQ156673; GQ156674; GQ156675; GQ156676; GQ156677; 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| MeSH Terms | |
Descriptor/Qualifier:
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Adenomatous Polyposis Coli
/
microbiology,
surgery Adult Bacteroidetes / genetics, isolation & purification Base Sequence Biopsy Cloning, Molecular Colitis, Ulcerative / microbiology, surgery Colonic Pouches / microbiology DNA, Bacterial / analysis Humans Male Middle Aged Molecular Sequence Data Pouchitis / microbiology* Proctocolectomy, Restorative Proteobacteria / genetics, isolation & purification RNA, Ribosomal, 16S / genetics* |
| Grant Support | |
ID/Acronym/Agency:
|
076964//Wellcome Trust; //Wellcome Trust |
| Chemical | |
Reg. No./Substance:
|
0/DNA, Bacterial; 0/RNA, Ribosomal, 16S |
| Comments/Corrections | |
Comment In:
|
Ann Surg. 2011 Oct;254(4):669; author reply 669-70
[PMID:
21892071
]
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